| Concelho | Percentagem da população contagiada até 16 de março | Total de casos registados até 16 de março |
| Aguiar da Beira | 15,28 | 711 |
| Castelo de Vide | 13,84 | 404 |
| Lousada | 12,30 | 5752 |
| Cuba | 12,12 | 557 |
| Paços de Ferreira | 12,02 | 6816 |
| Manteigas | 11,97 | 360 |
| Figueira de Castelo Rodrigo | 11,78 | 658 |
| Guimarães | 11,71 | 17830 |
| Póvoa de Varzim | 11,45 | 7188 |
| Sernancelhe | 11,25 | 607 |
| Vila do Conde | 11,03 | 8810 |
| Vila Nova de Famalicão | 10,98 | 14460 |
| Vimioso | 10,89 | 438 |
| Mêda | 10,55 | 484 |
| Armamar | 10,54 | 608 |
| Felgueiras | 10,50 | 5924 |
| Rio Maior | 10,46 | 2132 |
| Barcelos | 10,32 | 11996 |
| São João da Pesqueira | 10,32 | 735 |
| Boticas | 10,30 | 515 |
| Gavião | 10,24 | 334 |
| Alfândega da Fé | 10,22 | 465 |
| Trofa | 10,18 | 3910 |
| Póvoa de Lanhoso | 10,17 | 2187 |
| Vizela | 10,15 | 2426 |
| Pinhel | 10,15 | 864 |
| Penedono | 10,03 | 260 |
| Miranda do Douro | 9,99 | 682 |
| Setúbal | 9,96 | 11468 |
| Santo Tirso | 9,95 | 6773 |
| Esposende | 9,91 | 3386 |
| Caminha | 9,90 | 1572 |
| Tábua | 9,81 | 1115 |
| Fafe | 9,46 | 4545 |
| Loures | 9,40 | 20097 |
| Fornos de Algodres | 9,32 | 422 |
| Lisboa | 9,31 | 47436 |
| Odivelas | 9,25 | 14963 |
| Vieira do Minho | 9,25 | 1095 |
| Santa Maria da Feira | 9,21 | 12762 |
| Chaves | 9,18 | 3610 |
| Sintra | 9,13 | 35742 |
| Penacova | 9,12 | 1249 |
| São João da Madeira | 9,09 | 1995 |
| Bragança | 9,08 | 3053 |
| Ovar | 9,06 | 4915 |
| Alcácer do Sal | 9,04 | 1054 |
| Amadora | 8,93 | 16435 |
| Belmonte | 8,92 | 571 |
| Mora | 8,92 | 369 |
| Mourão | 8,90 | 218 |
| Ansião | 8,89 | 1070 |
| Marvão | 8,89 | 267 |
| Resende | 8,87 | 899 |
| Moimenta da Beira | 8,85 | 862 |
| Penafiel | 8,82 | 6152 |
| Vila Franca de Xira | 8,82 | 12516 |
| Mondim de Basto | 8,81 | 612 |
| Oliveira de Azeméis | 8,80 | 5808 |
| Ponte da Barca | 8,79 | 983 |
| Mogadouro | 8,70 | 730 |
| Paredes | 8,69 | 7478 |
| Vila Verde | 8,63 | 4049 |
| Sever do Vouga | 8,60 | 975 |
| Miranda do Corvo | 8,54 | 1085 |
| Murtosa | 8,51 | 875 |
| Braga | 8,47 | 15470 |
| Amarante | 8,46 | 4500 |
| Vila Nova de Paiva | 8,45 | 396 |
| Sátão | 8,41 | 974 |
| Freixo de Espada à Cinta | 8,31 | 274 |
| Penamacor | 8,31 | 395 |
| Coimbra | 8,30 | 11136 |
| Almada | 8,28 | 13993 |
| Castro Daire | 8,27 | 1143 |
| Figueiró dos Vinhos | 8,26 | 460 |
| Almeida | 8,23 | 480 |
| Alter do Chão | 8,21 | 260 |
| Guarda | 8,21 | 3201 |
| Lamego | 8,21 | 2043 |
| Espinho | 8,19 | 2418 |
| Estremoz | 8,17 | 1040 |
| Mafra | 8,16 | 6923 |
| Mealhada | 8,16 | 1624 |
| Moita | 8,14 | 5241 |
| Reguengos de Monsaraz | 8,06 | 807 |
| Vila Nova de Poiares | 8,06 | 559 |
| Arcos de Valdevez | 8,05 | 1685 |
| Arouca | 8,03 | 1664 |
| Cinfães | 7,93 | 1447 |
| Vale de Cambra | 7,92 | 1690 |
| Trancoso | 7,91 | 702 |
| Porto | 7,91 | 17132 |
| Valongo | 7,85 | 7653 |
| Palmela | 7,84 | 5038 |
| Vouzela | 7,82 | 752 |
| Gondomar | 7,78 | 12921 |
| Oliveira de Frades | 7,77 | 772 |
| Borba | 7,73 | 521 |
| Macedo de Cavaleiros | 7,70 | 1118 |
| Penalva do Castelo | 7,69 | 547 |
| Mangualde | 7,68 | 1421 |
| Vila Flor | 7,64 | 462 |
| Alvaiázere | 7,64 | 504 |
| Ferreira do Zêzere | 7,64 | 608 |
| Barreiro | 7,61 | 5722 |
| Ponte de Lima | 7,61 | 3145 |
| Valença | 7,61 | 1011 |
| Montalegre | 7,60 | 684 |
| Seixal | 7,59 | 12734 |
| Marco de Canaveses | 7,57 | 3899 |
| Nisa | 7,56 | 458 |
| Góis | 7,54 | 287 |
| Crato | 7,54 | 236 |
| Condeixa-a-Nova | 7,52 | 1334 |
| Tarouca | 7,52 | 587 |
| Oeiras | 7,52 | 13344 |
| Arronches | 7,52 | 212 |
| Melgaço | 7,51 | 608 |
| Alenquer | 7,48 | 3293 |
| Matosinhos | 7,45 | 13072 |
| Penela | 7,45 | 402 |
| Baião | 7,44 | 1394 |
| Cascais | 7,43 | 15876 |
| Viseu | 7,43 | 7223 |
| Amares | 7,39 | 1340 |
| Murça | 7,36 | 402 |
| Arganil | 7,34 | 808 |
| Vila Pouca de Aguiar | 7,33 | 877 |
| Arruda dos Vinhos | 7,33 | 1130 |
| Peso da Régua | 7,32 | 1154 |
| Anadia | 7,32 | 1994 |
| Sobral de Monte Agraço | 7,29 | 776 |
| Pampilhosa da Serra | 7,26 | 293 |
| Sabugal | 7,25 | 767 |
| Tabuaço | 7,24 | 437 |
| Alcanena | 7,24 | 927 |
| Cantanhede | 7,23 | 2531 |
| Valpaços | 7,18 | 1064 |
| Paredes de Coura | 7,14 | 609 |
| Santarém | 7,13 | 4095 |
| Vila Nova de Gaia | 7,13 | 21411 |
| Sesimbra | 7,11 | 3689 |
| Viana do Alentejo | 7,09 | 365 |
| Azambuja | 7,09 | 1611 |
| Benavente | 7,08 | 2166 |
| São Pedro do Sul | 7,05 | 1086 |
| Seia | 7,04 | 1565 |
| Vila Nova de Cerveira | 7,04 | 627 |
| Grândola | 7,01 | 1026 |
| Alcochete | 7,00 | 1386 |
| Fundão | 7,00 | 1854 |
| Celorico da Beira | 6,99 | 484 |
| Fronteira | 6,93 | 206 |
| Nelas | 6,91 | 897 |
| Águeda | 6,84 | 3150 |
| Torres Vedras | 6,83 | 5367 |
| Castanheira de Pêra | 6,81 | 178 |
| Mértola | 6,81 | 418 |
| Moura | 6,72 | 922 |
| Maia | 6,65 | 9245 |
| Celorico de Basto | 6,62 | 1261 |
| Monforte | 6,62 | 197 |
| Montemor-o-Novo | 6,62 | 1036 |
| Vila Nova de Foz Côa | 6,61 | 430 |
| Vila Real | 6,56 | 3280 |
| Ílhavo | 6,55 | 2534 |
| Alandroal | 6,53 | 326 |
| Ribeira de Pena | 6,45 | 388 |
| Santa Marta de Penaguião | 6,44 | 425 |
| Idanha-a-Nova | 6,43 | 517 |
| Terras de Bouro | 6,40 | 407 |
| Peniche | 6,37 | 1689 |
| Castelo de Paiva | 6,36 | 983 |
| Ourém | 6,36 | 2799 |
| Elvas | 6,33 | 1299 |
| Tomar | 6,32 | 2324 |
| Montemor-o-Velho | 6,32 | 1594 |
| Tavira | 6,31 | 1549 |
| Salvaterra de Magos | 6,30 | 1342 |
| Vila Real de Santo António | 6,29 | 1179 |
| Viana do Castelo | 6,28 | 5301 |
| Arraiolos | 6,28 | 435 |
| Beja | 6,28 | 2108 |
| Montijo | 6,26 | 3606 |
| Oliveira do Hospital | 6,18 | 1189 |
| Mação | 6,18 | 387 |
| Portalegre | 6,17 | 1369 |
| Covilhã | 6,13 | 2867 |
| Mirandela | 6,10 | 1328 |
| Pombal | 6,09 | 3135 |
| Castro Marim | 6,06 | 378 |
| Estarreja | 6,06 | 1576 |
| Aljustrel | 6,03 | 497 |
| Pedrógão Grande | 6,01 | 205 |
| Porto de Mós | 6,01 | 1399 |
| Castelo Branco | 5,99 | 3115 |
| Tondela | 5,97 | 1573 |
| Monção | 5,94 | 1062 |
| Aveiro | 5,91 | 4657 |
| Oliveira do Bairro | 5,91 | 1435 |
| Évora | 5,87 | 3080 |
| Campo Maior | 5,84 | 460 |
| Redondo | 5,84 | 371 |
| Almeirim | 5,81 | 1311 |
| Cabeceiras de Basto | 5,68 | 887 |
| Vinhais | 5,65 | 438 |
| Albergaria-a-Velha | 5,61 | 1354 |
| Coruche | 5,54 | 968 |
| Torres Novas | 5,54 | 1935 |
| Vila Viçosa | 5,53 | 423 |
| Mortágua | 5,52 | 486 |
| Soure | 5,48 | 939 |
| Figueira da Foz | 5,47 | 3213 |
| Carregal do Sal | 5,41 | 502 |
| Albufeira | 5,38 | 2235 |
| Lousã | 5,28 | 906 |
| Alijó | 5,28 | 561 |
| Faro | 5,22 | 3188 |
| Vendas Novas | 5,22 | 587 |
| Alcobaça | 5,18 | 2776 |
| Loulé | 5,17 | 3555 |
| Ourique | 5,14 | 237 |
| Cartaxo | 5,13 | 1224 |
| Ponte de Sor | 5,10 | 764 |
| Chamusca | 5,08 | 467 |
| Câmara de Lobos | 5,07 | 1706 |
| Leiria | 5,05 | 6329 |
| Gouveia | 5,03 | 623 |
| Caldas da Rainha | 5,01 | 2600 |
| Santa Comba Dão | 4,95 | 517 |
| Serpa | 4,93 | 705 |
| Entroncamento | 4,84 | 1043 |
| Batalha | 4,80 | 766 |
| Óbidos | 4,74 | 562 |
| Lourinhã | 4,67 | 1207 |
| Ferreira do Alentejo | 4,67 | 366 |
| Mira | 4,52 | 535 |
| Vagos | 4,46 | 1014 |
| Vidigueira | 4,45 | 245 |
| Lagos | 4,43 | 1345 |
| Nazaré | 4,41 | 625 |
| Sertã | 4,41 | 643 |
| Bombarral | 4,40 | 553 |
| Odemira | 4,37 | 1079 |
| Barrancos | 4,35 | 71 |
| Sabrosa | 4,34 | 257 |
| Golegã | 4,33 | 231 |
| Vila de Rei | 4,27 | 142 |
| Sousel | 4,26 | 188 |
| Ribeira Grande | 4,25 | 1395 |
| Marinha Grande | 4,20 | 1617 |
| Sines | 4,17 | 572 |
| Abrantes | 4,16 | 1463 |
| Mesão Frio | 4,11 | 163 |
| Constância | 4,09 | 165 |
| Portel | 4,03 | 235 |
| Alpiarça | 3,94 | 278 |
| Sardoal | 3,90 | 146 |
| Alcoutim | 3,89 | 84 |
| Cadaval | 3,79 | 518 |
| Torre de Moncorvo | 3,77 | 290 |
| Olhão | 3,75 | 1665 |
| Portimão | 3,74 | 2076 |
| Castro Verde | 3,74 | 260 |
| Vila Franca do Campo | 3,68 | 407 |
| Funchal | 3,68 | 3830 |
| Monchique | 3,55 | 180 |
| Almodôvar | 3,54 | 238 |
| Vila Nova da Barquinha | 3,48 | 260 |
| Santa Cruz | 3,44 | 1557 |
| Silves | 3,37 | 1222 |
| Oleiros | 3,34 | 167 |
| Santiago do Cacém | 3,28 | 943 |
| São Brás de Alportel | 3,24 | 337 |
| Vila Velha de Ródão | 3,21 | 101 |
| Alvito | 3,19 | 79 |
| Avis | 3,06 | 130 |
| Machico | 3,04 | 607 |
| Lagoa | 2,92 | 665 |
| Ponta do Sol | 2,84 | 244 |
| Proença-a-Nova | 2,82 | 206 |
| Carrazeda de Ansiães | 2,63 | 149 |
| Vila do Bispo | 2,54 | 131 |
| Ribeira Brava | 2,40 | 299 |
| Porto Santo | 1,75 | 91 |
| Lagoa - Açores | 1,65 | 243 |
| Porto Moniz | 1,37 | 32 |
| Aljezur | 1,30 | 73 |
| Santana | 1,30 | 87 |
| Ponta Delgada | 1,26 | 853 |
| Nordeste | 1,19 | 58 |
| Povoação | 1,18 | 70 |
| Calheta | 1,12 | 122 |
| Angra do Heroísmo | 1,04 | 353 |
| Praia da Vitória | 0,86 | 183 |
| Calheta - Açores | 0,85 | 27 |
| São Vicente | 0,82 | 42 |
| Madalena | 0,51 | 30 |
| Horta | 0,50 | 72 |
| São Roque do Pico | 0,49 | 16 |
| Vila do Porto | 0,45 | 25 |
| Velas | 0,43 | 22 |
| Corvo | 0,43 | 2 |
| Santa Cruz da Graciosa | 0,36 | 15 |
| Santa Cruz das Flores | 0,32 | 7 |
| Lajes do Pico | 0,22 | 10 |
| Lajes das Flores | 0,21 | 3 |