O caso do roubo de Tancos foi a gota de água e o fim de linha para José Alberto Azeredo Lopes. Mas não foi a única polémica do seu mandato enquanto titular da pasta da Defesa. Teve de enfrentar – o que levou à demissão do chefe do Estado Maior do Exército – as polémicas declarações do subdirector do Colégio Militar sobre alunos homossexuais e de como eram aconselhados a afastá-los dessa instituição de ensino militar. Mais tarde enfrentou o caso das mortes dos comandos. Mas o furto de Tancos foi o que levou Azeredo Lopes à demissão, depois de ter sido noticiado de que o ministro da Defesa tinha sido informado sobre a encenação na devolução das armas.